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BMJ小小統計問題(19)

Statistical tests for independent groups: time to event data                                                         

https://www.bmj.com/content/345/bmj.e5257

Cite this as: BMJ 2012;345:e5257

前言:

本週三提供18題存活分析練習題,內容包括存活分析重要概念與實際應用方面。已經收到幾位朋友作答,結果將作為明年存活分析課程設計之參考 本周的BMJ 19-20為存活分析組別差異檢驗再進行說明和複習,BMJ存活分析系列將先告一段落。之後將推薦存活分析有趣又實用的臨床研究應用之文獻,如:當不同組別存活曲線交叉,不符合前提假設怎麼處理?如何形成另一個有價值的研究主題?如何由存活分析曲線評估特定處置、治療的近期、遠程效應?如何進行這類型之研究設計與分析?

 

存活分析本身有很多寶藏可以挖掘,是研究人員需要深入瞭解的重要統計方法之一。有關存活分析概念與進階應用會在明年度的存活分析課程進行講解。

目前BMJ統計針對存活分析主題列表如下:

#BMJ統計問題(12):風險比 (Hazard ratio) 的解釋

#BMJ統計問題(13):KM 存活曲線:風險 (Risk)的解釋和溝通

#BMJ統計問題(14):Cox比例風險迴歸 (Cox proportional hazards regression)

#BMJ統計問題(15):存活 (時間到事件) 資料 I

#BMJ統計問題(16):存活 (時間到事件) 資料:中位存活時間

#BMJ統計問題(17):如何看Kaplan-Meier 存活曲線圖 (How to read a Kaplan-Meier survival plot)

#BMJ統計問題(18):The log rank test

#BMJ統計問題(19):Statistical tests for independent groups: time to event data

#BMJ統計問題(20):Hazard ratios

#存活分析測驗:https://forms.gle/HzaXcQxjMs1mmdQD6

匯東華課程介紹 

題目:

研究人員評估低劑量、高頻超音波與標準護理相結合治療小腿靜脈潰瘍的有效性,這些潰瘍很難癒合。進行一項為期12個月的多中心隨機對照試驗。接受超音波檢查12周後,參與者回到單獨接受標準護理治療[1]。對照組僅採用標準治療。若病人至少有一個下肢靜脈潰瘍持續時間超過6個月或面積大於5平方釐米,且踝肱壓力指數>0.8,則招募為試驗參與者。

 

有168人隨機接受超聲合併標準治療,169人只接受標準治療。主要結果是從隨機分組到符合條件的最大的腿部潰瘍(稱為參考潰瘍)癒合的時間。研究人員報告指出治療組之間在參考腿潰瘍癒合之前的時間沒有顯著差異(P=0.61)。

  

下列哪一項統計檢驗可用於比較不同治療組間參考腿潰瘍癒合的時間? (單選)

a) χ2 test

b) Fisher’s exact test

c) Log rank test

d) Logistic regression

 

  

答案:c正確,log rank test (答案c)將被用來比較治療組別在參考腿潰瘍癒合之前的時間。

 

詳細說明:

該研究調查不同治療組間的參考腿潰瘍癒合時間是否不同。從分組到治療直到完全癒合的時間被稱為事件時間(time to event)或生存資料(survival data) [2]。

 

Log rank test (答案c)用於檢驗在12個月的研究期間,兩治療組的存活時間是否有任何差異。與傳統的假設檢驗一樣,log rank test 從”相等”開始。虛無假設表示,在獲得樣本的母群體中,治療組間的參考腿潰瘍癒合時間在12個月內沒有差異。對立假設認為存在差異:在獲得樣本的母群體中,兩種處理之存活時間在前12個月不相等。對立假設是雙尾的:超音波治療組的存活時間可能比對照組短或長。報導的P值為0.61,因此在5%的臨界顯著水準下,沒有拒絕虛無假設,支持對立假設。得出的結論是不同治療法對參考潰瘍的癒合時間無顯著差異。

 

log rank test純粹是一種顯著性檢驗,提供了研究期間治療組間之存活時間差異的整體考驗。它沒有提供治療組之間存活時間差異的估計。此外,在使用log rank test比較兩組存活時間時,不可能對干擾效應進行調整。中位存活時間和危險比值(HR)[3][4]可以用來估計治療組之間存活時間差異的大小。

 

χ2檢驗(答案a)和Fisher精確檢驗(答案b)具有相似的目的,因為它們都確定具有兩個或多個類別的變數在兩個或多個獨立組中的分佈是否相等[5]。要使χ2檢驗有效,必須滿足某些條件。如果χ2檢驗無效,則使用Fisher精確檢驗。不管χ2檢驗的有效性如何,Fisher的精確檢驗總是可以用作χ2檢驗的替代方法。

 

在上述範例中,次要結果包括參與者在12個月時所有潰瘍癒合的比例。在隨機分組後的12個月,168名接受超音波治療的參與者中有72人,而接受標準治療的169名參與者中有78人的潰瘍全部癒合。χ2檢驗或Fisher精確檢驗均可用於比較研究結束時所有潰瘍癒合的參與者的治療比例。結果指出,12個月時兩組間無顯著差異(P=0.39 (Fisher精確檢驗))。

邏輯式迴歸(答案d)用於推倒未經調整和調整的勝算比(odds ratio, OR)。OR描述的是存在相對於不存在危險因子的一種疾病或情況的可能性[6]。

 

 

Reference:

[1] Watson JM, Kang’ombe AR, Soares MO, Chuang LH, Worthy G, Bland JM, et al; on behalf of the VenUS III Team. Use of weekly, low dose, high frequency ultrasound for hard to heal venous leg ulcers: the VenUS III randomised controlled trial. BMJ

2011;342:d1092.

[2] Sedgwick P. Survival (time to event) data: censored observations. BMJ 2011;343:d4816.

[3] Sedgwick P, Joekes K. Survival (time to event) data: median survival times. BMJ 2011;343:d4890

[4] Sedgwick P. Hazard ratios. BMJ 2011;343:d5918.

[5] Sedgwick P. Statistical tests for independent groups: categorical data. BMJ 2012;344:e344.

[6] Sedgwick P. Odds ratios and adjusting for confounding. BMJ 2010;341:d6833.

 

 數據串接與清洗

數據是礦藏,數據清洗是挖出鑽石的第一步,尤其是巨量知識。數據清洗或串接執行過程需要細心與專注,且有可能會消耗許多時間和精力,就由我們來替各位處理掉這個大麻煩。

全民健保研究資料庫、國外大型資料庫資料非常齊全,種類多,需要串接與清洗,進行正規化後才能更進一步進行資料探勘與統計分析。




Fig1.同一個Project資料散落在不同tables,無法使用




Fig2.整併與清理為可分析的table




Fig.3整理和分析後形成有意義的知識


概念與流程示意圖

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臨床研究基本原則 : https://www.youtube.com/watch?v=1tTApx1hjn0

 計畫撰寫與統計諮詢





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