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存活分析結果展現示意
研究資料:心衰竭臨床記錄資料集(299例)
變數摘要:(本文件為範例,非每個變數都會使用)
資料來源:加州大學歐文機器學習庫樣本
資料說明:
age:病人的年齡(年) |
anemia:紅血球或血紅蛋白減少 |
high blood pressure:病人是否患有高血壓 |
creatinine phosphokinase (CPK):血液中 CPK酵素的水準 (mcg/L) |
diabetes:是否患有糖尿病 |
ejection fraction:每次收縮時離開心臟的血液百分比(百分比) |
platelets:血液中的血小板含量(千血小板/毫升) |
sex:性別(0表示女,1表示男) |
serum creatinine:血液中的血清肌酸酐水準(mg/dL) |
smoking:是否吸菸 |
time:追蹤時間(天) |
death event:患者是否在追蹤期間死亡(0表示存活,1表示死亡) |
研究主題:
抽菸(X)對心衰竭病人死亡(Y)風險之影響
分析結果:
Table 1 baseline characteristics
Variables |
Total (n=299) |
non-smoking (n=203) |
smoking (n=96) |
p |
Age, median(IQR) |
60.0 (51.0,70.0) |
60.0 (50.0,69.0) |
60.0 (52.0,70.0) |
0.603 |
Male, n(%) |
194(64.9) |
102(50.2) |
92(95.8) |
<0.001 |
Anemia, n(%) |
129(43.1) |
95(46.8) |
34(35.4) |
0.064 |
Diabetes, n(%) |
125(41.8) |
95(46.8) |
30(31.3) |
0.011 |
Hypertension, n(%) |
105(35.1) |
75(36.9) |
30(31.3) |
0.335 |
Serum sodium, median(IQR) |
137.0 (134.0,140.0) |
137.0 (134.0,140.0) |
137.0 (135.0,139.0) |
0.886 |
Serum creatinine, median(IQR) |
1.1 (0.9,1.40) |
1.1 (0.90,1.50) |
1.100 (0.900,1.300) |
0.769 |
Creatinine phosphokinase, median(IQR) |
250.0 (115.0,582.0) |
281.0 (115.0,582.0) |
224.000 (122.0,582.0) |
0.601 |
說明:
不同smoking分組中各個指標的差異是否具有統計學意義,有效樣本為299例,其中non-smoking病例數為203;smoking病例數為96;
sex經卡方檢驗p<0.05,組間差異存在統計學意義。
Hypertension經卡方檢驗p>0.05,組間差異不存在統計學意義。
diabetes經卡方檢驗p<0.05,組間差異存在統計學意義。
anaemia經卡方檢驗p>0.05,組間差異不存在統計學意義。
Table 2 The univariate analysis with Mortality
Variables |
Total (n=299) |
Alive (n=203) |
Death (n=96) |
p |
smoking, n(%) |
96(32.107) |
66(32.5) |
30(31.3) |
0.827 |
Age, median(IQR) |
60.0 [51.0,70.0] |
60.0 [50.0,65.0] |
65.0 [55.0,75.0] |
<0.001 |
Male, n(%) |
194(64.883) |
132(65.025) |
62(64.6) |
0.941 |
Anemia, n(%) |
129(43.144) |
83(40.9) |
46(47.9) |
0.252 |
Diabetes, n(%) |
125(41.806) |
85(41.872) |
40(41.7) |
0.973 |
Hypertension, n(%) |
105(35.117) |
66(32.512) |
39(40.6) |
0.170 |
Serum sodium, median(IQR) |
137.0 [134.0,140.0] |
137.0 [135.0,140.0] |
136.000 [133.0,138.0] |
<0.001 |
Serum creatinine, median(IQR) |
1.1 [0.9,1.4] |
1.0 [0.9,1.2] |
1.3 [1.1,1.9] |
<0.001 |
說明:
不同死亡狀態分組中各個指標的差異是否具有統計學意義。有效樣本為299例,其中Alive:病例數為203;Death:病例數為96;
smoking經卡方檢驗p>0.05,組間差異不存在統計學意義。
anaemia經卡方檢驗p>0.05,組間差異不存在統計學意義。
diabetes經卡方檢驗p>0.05,組間差異不存在統計學意義。
Hypertension經卡方檢驗p>0.05,組間差異不存在統計學意義。
sex經卡方檢驗p>0.05,組間差異不存在統計學意義。
serum sodium經Mann-Whitney U檢驗p值<0.05,組間差異存在統計學意義。
serum creatinine經Mann-Whitney U檢驗p值<0.05,組間差異存在統計學意義。
age經Mann-Whitney U檢驗p值<0.05,組間差異存在統計學意義。
方法名稱:存活分析與K-M存活曲線
說明:以smoking分組的病人之生存時間的Log Rank test檢定統計量為=0.002,對應的HR= 0.99,對應的p=0.964。依據Log Rank test結果,認為有無吸菸的病人生存時間無顯著性差異。non-smoking的患者中status存活中位數為NA存活50%對應的存活時間95%信賴區間:(235,NA)。smoking的患者中status存活中位數為NA存活50%對應的存活時間95%信賴區間:(241,NA)。說明:由於死亡機率未達50%,因此,無法估算中位數存活時間。
分析結果說明表:
index |
總數 |
事件數 |
中位數 |
95%CI下限 |
95%CI上限 |
non-smoking |
203.0 |
66.0 |
nan |
235.0 |
nan |
smoking |
96.0 |
30.0 |
nan |
241.0 |
nan |
Kaplan-Meier survival curve:提供客製化選擇
下列項目請於提出需求時,填寫清楚
1.四種頂級期刊風格可供選擇,包含NEJM、Lancet、JAMA、NPG。
2.有無需要呈現95%信賴區間?(範例如圖2及圖6)
3.有無需要顯示風險表(population at risk table)?(範例如圖2、圖3及圖4)
4.可調整X軸刻度間距、X軸最大值及Y軸最小值。
1.期刊風格 |
1.NEJM |
2.Lancet |
3.JAMA |
4.NPG |
2.95%信賴區間 |
需要 |
不需要 |
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3.風險表 |
需要 |
不需要 |
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4.X軸(時間)間距 |
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5.X軸(時間)最大值 |
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6.Y軸(存活機率)最小值 |
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客製化選擇示意圖(figure1)
Table 3 and Table 4
常規分析為整體的Cox PH regression full model (table 3)結果以及Stepwise model (table 4)結果。有需要可加購subgroup分析(下方table 3 + figure 2+figure 3),加購價900元。subgroup analysis不一定可以執行,視實際需求與樣本數而定。
說明:構建分層分析的Cox迴歸模型
觀察smoking變化與死亡率間的關係, 對樣本進行分層處理,以觀察不同sex分層樣本中smoking對死亡事件影響的差異。
adjusted Model :調整模型增加的協變數為serum creatinine, diabetes ,anemia, age。結果顯示在控制其他變數後,抽菸對死亡風險的影響隨著性別而不同。女性之aHR=3.877 (95% CI=1.13-13.30)顯示,有抽菸的女性心衰竭病人相較於沒抽菸女性的死亡風險為3.877倍,達到統計學上顯著關係。相反地,男性抽菸病人死亡風險為不抽菸組的0.98倍,其95% CI=0.586-1.64,跨過1,顯示抽菸不會增加死亡風險。
HR 95% 森林圖(figure2&3)
Table 3 subgroup analysis for sex
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Fig1.同一個Project資料散落在不同tables,無法使用
Fig2.整併與清理為可分析的table
Fig.3整理和分析後形成有意義的知識
概念與流程示意圖
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